超级计算机的窘境：软件开发滞后限制其应用

　　魔方的诞生将中国的超级计算一下子带入了百万亿次计算时代，但是应用却仍停留在几万亿次到几十万亿次的水平，中间至少相差了一代。因为现在能够写此类软件的人才太过稀少，硬件跟软件的关系就像修了一条好路，却没有好车。2009年6月15日，国内首台百万亿次超级计算机魔方，在上海正式启用。魔方不但是亚洲第一的超级计算机，也是目前美国本土之外唯一计算速度排名进入全球前十的超级计算机，表明中国成为全球第二个能够研发百万亿次超级计算机的国家。上图为超级计算中心主控机房。
　　现在的超级计算机通常都有几千颗CPU，速度已经超过每秒千万亿次，但能支持500颗以上CPU的应用软件却很少。像国家天文台需要上千个CPU的运算却缺少软件可用。
　　上海超级计算中心总共有300多个用户，医生丁海是其中一个。他独立研究的课题涉及较复杂的模拟计算，用普通的电脑根本跑不起来，于是他到超算中心，申请使用一部分计算资源。
　　128颗CPU的极限
　　到超算中心排队的单位一直很多。截至2008年，中心装备的曙光4000A型超级计算机CPU使用率已达到88.5%。这台拥有2048颗CPU的超级计算机已经接近满负荷运转。2009年6月，魔方的加盟将中心可提供的计算能力一下字提升了20倍。它是曾在2008年底排名世界前十的计算机，峰值运算速度达到每秒230万亿次。然而没能进入队列的任务还是很多。
　　丁海只需要用几十颗CPU，但在300多个用户中已经略高于平均数虽然中心的客户中不乏蛋白质折叠这样的大型科学计算和国产大飞机设计这样的大型工程项目，但大型用户并不占大多数。据上海超算中心2008年12月的简报统计，在当月新增的10个用户里，只有清华大学航空航天学院、南京大学物理系和上海天文台三家占用的CPU资源在128颗以上。
　　不可能给得太多，中心副主任袁俊说。中心为了照顾到300多个用户的需要，必须进行协调管理，才能最大发挥其整体效能。成立于2000年的上海超算中心不仅承担着国家网格计划的南方主节点任务，还为华东地区乃至全国的科研单位和工程用户提供开放的计算服务。袁俊告诉记者，128颗，往往是上海超算中心为单个任务所能提供CPU数的最大值。
　　事实上，即使资源方面没有限制，很多大型项目也因为技术上的原因用不上那么多运算资源。